
一、基因敲降的前期準備工作相同1.1?生物信息學(xué)分析目標基因在斑馬魚(yú)早期胚胎發(fā)送過(guò)程中是否有表達。1.2?收集斑馬魚(yú)早期發(fā)育胚胎(通常為48?hpf?前的胚胎),提取總RNA,然后進(jìn)行體外轉錄(RT)。1.3?設計檢測目標基因表達的PCR?引物,以1.2獲得的cDNA?為模板,進(jìn)行PCR?擴增,確認目標基因在早期有表達。二、MO法與CRISPRi法的敲降原理不同2.1?MO?是在轉錄后水平上敲降基
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一、基因敲降的前期準備工作相同1.1?生物信息學(xué)分析目標基因在斑馬魚(yú)早期胚胎發(fā)送過(guò)程中是否有表達。1.2?收集斑馬魚(yú)早期發(fā)育胚胎(通常為48?hpf?前的胚胎),提取總RNA,然后進(jìn)行體外轉錄(RT)。1.3?設計檢測目標基因表達的PCR?引物,以1.2獲得的cDNA?為模板,進(jìn)行PCR?擴增,確認目標基因在早期有表達。二、MO法與CRISPRi法的敲降原理不同2.1?MO?是在轉錄后水平上敲降基
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一般推薦MO+CRISPRi兩種策略去同時(shí)敲降一個(gè)基因,由于MO是在轉錄后水平上敲降基因的功能,而CRISPRi是在轉錄水平上敲降基因的功能,使用兩種獨立的、原理完全不同的敲降方法,如果給出的敲降效果(表型)是一樣的,那么這樣建立的敲降方法可以被認可是有效且特異的。請大家注意:評價(jià)基因敲降效果需要從有效和特異兩個(gè)方面來(lái)考慮。有效性問(wèn)題:CRISPRi敲降的有效性可以通過(guò)RT-PCR法檢測目標基因表
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